在医疗环境中，能够快速访问数据至关重要。例如，败血症患者的存活率每小时下降4%，因为我们不能诊断出引起感染的物种，并用适当的抗生素方案进行干预[1,2]。

典型的基因组分析太慢。你将DNA样本从采集点运送到一个集中的设备，在一个批处理过程中进行测序和分析，这可能需要数周甚至数月的时间。最近，纳米孔DNA测序仪已经商业化，可视化数据大屏，可以在收集原始信号水平数据时对其进行流式处理，并提供对其的即时访问。然而，实时处理数据仍然具有挑战性，需要大量的计算和存储资源，以及专门的生物信息学家。这一过程不仅速度太慢，而且容易失败，大数据精准，成本高昂，无法扩展。

我们最近为基因组学研究人员和生物信息学开发人员建立了一个概念验证，突出了谷歌云数据处理工具的广度和深度。在这篇文章中，我们描述了一个可扩展、可靠、经济高效的端到端管道，淘客猪，用于基于谷歌云和这类新型纳米孔DNA测序仪的快速DNA序列分析。

我们设想了四种可以使用此应用程序的场景，特别是用于检测生物污染物：

在所有情况下，分析结果可在动态仪表板中获得，数据无价，选购云服务器，以便立即了解、决策和采取行动。

以下是昆士兰大学应用程序对DNA纳米孔测序仪数据进行实时分析的视频：